Phòng khám đông y tồn tại và phát triển dựa trên giá trị cốt lõi của y học cổ truyền: lấy con người làm trung tâm, điều trị từ gốc, đề cao sự cân bằng giữa thân – tâm – khí – huyết. Tuy nhiên, khi xã hội thay đổi, số lượng bệnh nhân tăng lên, yêu cầu pháp lý và quản trị ngày càng chặt chẽ, mô hình vận hành truyền thống dựa nhiều vào kinh nghiệm cá nhân bắt đầu bộc lộ những hạn chế. Từ thực tế đó, quản lý phòng khám đông y không còn là vấn đề “nội bộ” mà trở thành yếu tố quyết định sự tồn tại và phát triển lâu dài của mỗi cơ sở đông y. Việc quản lý tốt không làm mất đi bản sắc y học cổ truyền, ngược lại còn giúp bảo tồn tri thức, chuẩn hóa quy trình và nâng cao uy tín chuyên môn. Một hệ thống quản lý khoa học sẽ tạo cầu nối giữa tinh hoa chữa bệnh cổ truyền và phương pháp điều hành hiện đại, giúp phòng khám hoạt động hiệu quả, an toàn và đúng quy định của ngành y tế.